Cómo combinar la ingeniería biomédica y la ingeniería de software mientras realizas una maestría en la Universidad de Washington

Cuando esté buscando un Programa BioMédico de MS, mire a la facultad que apoya / enseña / orienta su programa. Estas personas también están investigando y son esas iniciativas de investigación las que desea aprovechar para diseñar un proyecto de tesis que cumpla con sus objetivos para sistemas integrados y biomecánica / prótesis. No tienen que estar haciendo exactamente lo que quieres, pero definitivamente sabrán quién está trabajando en esa línea, cuál sería un proyecto potencial y si estarían dispuestos a actuar como tu asesor de tesis.

Mucho de lo que hace que un programa de MS sea diferente de un programa de BS es el grado de iniciativa que se espera que tenga. También necesita contribuir con un par de documentos para completar su experiencia en EM y establecer un poco de base académica, que es el trampolín para un doctorado.

Debe ingresar al estadio de béisbol con sus intereses deseados, y luego debe estar abierto a los “vientos de la casualidad”, en cuanto a lo que podría ser su proyecto resultante. Realmente no puede esperar tener un control completo sobre el camino o el resultado. Pero puede aumentar sus oportunidades si es flexible en sus “condiciones iniciales”. Puede aprender sistemas integrados por su cuenta (o mediante MOOC) para hacerse más interesante para una posible publicación o programa.

Para algunas consideraciones adicionales, aquí está mi experiencia específica:

Si bien tuve la iniciativa de ponerme en un camino biomédico, a partir de mi tesis superior fue construir un sistema experto de diagnóstico para evaluar los resultados de las pruebas de diabetes en un entorno clínico, las dificultades que tuve para validar ese sistema me permitieron concluir que hacer Algo similar para mi tesis de EM podría ser arriesgado. Sabía que quería hacer algo con el software, ya sea simulación o imágenes, por lo que tomé una pequeña beca de investigación con el departamento de farmacología de la UMDNJ. Esto me involucró en varios proyectos:

  • medir el flujo sanguíneo a través de imágenes, interactuando con el equipo HP para la adquisición de imágenes
  • Reconstrucción tridimensional de micrografías seriales para medir la arquitectura de los vasos sanguíneos.
  • simulación de liberación de calcio en vasos sanguíneos
  • mejoras de software para la adquisición de datos en tiempo real de la conducción nerviosa

Mis habilidades de software no incluían el lenguaje ensamblador necesario para interactuar y procesar los datos de la imagen, por lo que contribuí haciendo una gran cantidad de recopilación de datos y preprocesamiento, ¡algo similar a lo que está tratando de evitar! Esto me dio una cuenta en las máquinas HP, que eran las más capaces en la universidad. También podría asociarme más libremente con los profesores que hicieron la mayor parte del trabajo con esos sistemas. Este era simplemente un camino inexplorado que mis compañeros no habían considerado.

Todos los demás proyectos de software estaban basados ​​en PC (PC-AT en ese momento). Las simulaciones utilizaron coprocesadores matemáticos de nuevo diseño (alrededor de 1986) que eran un poco defectuosos y las simulaciones tardaron aproximadamente (3) días en ejecutarse. Un par de mis compañeros estaban haciendo este trabajo. El modelo que me dieron fue mucho más complicado y tardó unos 10 días en ejecutarse. Estimamos que tomaría alrededor de 50 a 100 corridas para analizar todos los parámetros necesarios para el estudio, lo que lo colocó fuera de los dos años que me permitieron el proyecto. Este era el desafío que realmente perseguiría.

Hice un breve estudio para transferir los códigos FORTRAN al entorno HP (PC -> UNIX) y luego a C, con otra docena de corridas de validación. La máquina HP más capaz redujo las ejecuciones a 3 días y también evitó todas las ejecuciones fallidas debido a fallas en el hardware. El trabajo de fondo que realicé para obtener imágenes del flujo sanguíneo condujo a un libro sobre la optimización del cálculo de ecuaciones diferenciales (runge-kutta) y decidí dedicar algo de tiempo a la implementación, lo que resultó en un algoritmo de ajuste que redujo los tiempos de ejecución a 3 minutos, después de comprometer la precisión a 12 decimales. Ese se convirtió en el hallazgo de mi tesis.

El otro trabajo en reconstrucción 3-D, donde también manejé (2) otros estudiantes para sus proyectos de tesis, esto me consiguió mis primeras (2) publicaciones.

En general, cumplí mis objetivos para lo que quería hacer en mi trabajo de EM. Y obtuve una visión muy detallada de cómo funcionaba la investigación académica en un entorno médico, ¡tal vez demasiado!

¡Decidí no ir más lejos académicamente simplemente porque estaba cansado de estar en la ruina! Tomé un trabajo en la industria del software, persiguiendo sistemas embebidos de alto rendimiento, adquisición de datos y acondicionamiento de señal, y luego pasé a la computación de propósito general y las arquitecturas de soluciones, especializándome en el rendimiento de los sistemas de software. He escrito docenas de documentos solo internos y me las arreglé para sacar un par de documentos al aire libre y un libro. Creo que mis asesores estarían muy contentos de cómo me fue en mi carrera, así como por el entretenimiento que proporcioné a medida que desarrollé mi experiencia simplemente por estar abierto a probar las cosas “.

En resumen, pensé que sabía mucho sobre computadoras cuando comencé mi MS. Fui un gran problema durante mi BS y esto me invitó a un programa de maestría, pero esto no fue nada comparado con lo que tendría que aprender para contribuir a la investigación académica ‘real’. Cuando llegué a la industria, esas experiencias de investigación fueron muy valoradas, pero nuevamente tuve que aceptar que tenía “solo una idea” de lo que realmente implicaba la informática, y pasaría los siguientes 10 años mejorando aún más mi conocimiento de la ingeniería de software y sistemas.

No sea demasiado rígido en el camino que debe seguir su programa. ¿Qué pasa si no puede entregar el sistema integrado? ¿Qué pasa si se trata de un órgano artificial o un proyecto de telemetría? Debe mantener sus opciones abiertas porque asegúrese de que haya mucha investigación en curso y afiliada a su programa. Lo que sea que persiga será un gran paso desde donde se encuentra hoy, siempre que esté abierto a las oportunidades.

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