¿Quién contrata a los desarrolladores de software bioinformático y cuáles son sus roles principales?

La bioinformática parecería una buena opción como enfoque para un título de posgrado en CS porque lo familiarizará con una gran cantidad de técnicas de análisis de datos importantes y prácticas. Sin embargo, es importante entender que la atención se centra en algoritmos y datos, no en biología o medicina.

Los datos procesados ​​en bioinformática suelen ser enormes. Por ejemplo, solo 2 microgramos de ADN necesitan ~ 1 PB de almacenamiento en una base de datos. Esto significa que la técnica de datos de vanguardia debe aplicarse para aprender de este tipo de datos, esto incluye muchas técnicas utilizadas en la industria fuera de la bioinformática (casi todas las grandes empresas de software tienen grandes necesidades de datos).

Cosas como la minería de datos, trabajar con GPU para procesar datos rápidamente y en paralelo, el papel Dremel de Google, etc., se usan comúnmente en el procesamiento de datos bioinformacionales. Con una sólida experiencia en el trabajo con tales herramientas obtenidas de unos años de estudio y trabajo en bioinformática, uno podría convertirse en un candidato interesante para la mayoría de las compañías de software, incluidas las grandes como Intel, Google, Microsoft, Facebook, etc., donde se encuentran los grandes datos acostumbrado a que sea extremo.

Solía ​​trabajar en UCDavis, principalmente trabajando en CASP hace unos seis años.

Ahora hay grandes cantidades de datos que necesitan ser procesados ​​y entendidos en bioinformática, pero el campo está inventando herramientas para hacerlo muy lentamente.

La mayoría de las empresas que estaban interesadas en nuestra investigación eran grandes corporaciones farmacéuticas e instituciones académicas. La comunidad estaba muy dispersa y había cierta sensación de estancamiento relacionada con las técnicas de plegamiento de proteínas.

Volviendo a Europa, tengo algunas ofertas de trabajo de los departamentos de I + D y algunas nuevas empresas relacionadas con la ciencia médica.

Mis tareas principales eran el análisis de datos “grandes” (minería de datos), aprendizaje automático, detección de patrones y predicción de modelos. Tanto la creación de software personalizado como la aplicación de herramientas existentes. Por lo general, en cooperación con expertos en dominios en biología.

En el teléfono, por lo que debe ser conciso, la bioinformática solía jugar un papel muy pasivo, en los días en que había datos limitados. Pero con la acumulación de datos, y en particular los datos que están disponibles públicamente, ahora puede desempeñar un papel muy activo. Se pueden formar hipótesis esencialmente tangibles, simplemente mirando suficientes conjuntos de datos, en muchos casos que están disponibles gratuitamente, para informar sobre experimentos específicos para ejecutar, lecturas biológicas específicas para monitorear, etc., ahorra dinero y tiempo al mismo tiempo …

Bueno, no es un proceso realmente fácil cruzar datos, información y luego conocimiento que pueda dirigir nuestra actividad de investigación. Muchos investigadores hacen públicos, cada uno de los investigadores tiene los datos para abordar su investigación, pero muchos conjuntos de datos biológicamente relevantes pueden investigarse juntos, articularse cuando proceden de contextos biológicos muy diversos.

En cuanto al mercado laboral, solía estar en una organización de investigación, luego en compañías farmacéuticas, ahora muchas compañías de diagnóstico

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