¿Cómo se puede pasar de una carrera de ingeniería de software a las ciencias de la vida (por ejemplo, biología sintética)?

Soy biólogo de profesión, y las matemáticas no son un punto fuerte para mí. Pero me interesé en el modelado matemático porque la biología puede ser frustrantemente adivinar: para probar un modelo, cambias algo en el organismo y luego ves lo que sucede. Si puede construir un modelo integral en silico y luego probar todos los parámetros en combinación, puede identificar los puntos críticos del sistema y comenzar su investigación con ellos. Eso es lo que hice para mi EM, usé un modelo para predecir la mejor manera de optimizar un sistema biológico sintético, y todo lo que usé fueron ecuaciones diferenciales.

Tenía 27 años cuando comencé mi maestría, así que no dejes que eso te intimide. No dejes que las matemáticas te intimiden tampoco: es algo que puedes aprender y que incluso quizás ya lo sepas. También estaba aprendiendo a usar Matlab al mismo tiempo, así que ya estás un paso por delante de donde estaba yo. Estos dos documentos comenzaron el campo y le darán una idea de las matemáticas involucradas en algunos proyectos: 1) Gardner (página en wustl.edu) 2) Elowitz (página en caltech.edu).

Si yo fuera tú, iría a la escuela de posgrado. Primero echaré un vistazo a los lugares con equipos de IGEM (International Genetically Engineered Machine): definitivamente hay escuelas en Europa que participan en esta competencia y tendrán algunos buenos recursos para usted.

Hice el modelado molecular (piense en las vías biosintéticas y las moléculas de señalización), pero el modelado de proteínas es otro campo muy computacionalmente intensivo. Es posible que desee estudiar el trabajo de David Baker para comenzar: su laboratorio es el líder en este campo.

¡Feliz de chatear si quieres hablar más sobre esto!

Las compañías de biología sintética emplean desarrolladores en muchos roles. Podrías buscar un trabajo con uno de ellos y usarlo para avanzar más hacia el lado biológico. También hay grandes organizaciones de investigación, como JGI o The Broad Institute, que emplean desarrolladores.

Muchas personas de bioinformática / biología computacional son grandes en software abierto y de código abierto. Entonces podría comenzar a contribuir a un proyecto de código abierto y también podría comenzar a aprender el campo explorando por su cuenta. Por ejemplo, busque en la web “tutorial de modelado bioquímico” y encontrará una gran cantidad de guías y tutoriales del curso.

¡Buena suerte!

De muchas maneras. Por ejemplo, mediante el desarrollo de software para cinética enzimática, para el análisis estadístico de experimentos biológicos, para el modelado 3D y la visualización de la interacción de drogas con células y tejidos, la simulación de la respuesta del cuerpo a estímulos, la cibernética animal, el modelado ecológico, el desarrollo de modelos informáticos basados ​​en la evolución. soluciones de animales y plantas a problemas de ingeniería, la lista es interminable …

La biología sintética sigue siendo un campo en desarrollo, por lo que creo que habrá más oportunidades para usted en la academia que en la industria. Pero si estás pensando en la escuela de posgrado, algo así como la mitad de mi clase de doctorado tenía 26 años o más, así que no dejes que eso te detenga. Tampoco tienes que ser increíble en matemáticas para hacer un buen trabajo en biología sintética; Ya no trabajo en ese campo, pero como recuerdo, gran parte es solo el razonamiento lógico normal de la biología molecular con tal vez un poco de modelado de diferencias incorporado.

Si pudieras ofrecerte como voluntario en un laboratorio, tal vez uno que dirija un equipo de iGEM como mencionó Keira (lo hice iGEM en 2005, ¡prácticamente en la edad oscura en este punto!), Definitivamente podrías adquirir algo de experiencia en laboratorio húmedo y ver si esto es algo que desea perseguir a largo plazo. La experiencia de laboratorio también ayudaría mucho con los ingresos a las escuelas de posgrado. Y hay muchos equipos de iGEM en toda Europa, lo que significa que probablemente no sería tan difícil encontrar un laboratorio dispuesto a contratarlo que fuera algo local.

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